特別補償は、旅行者に故意・過失がなくても負わなければならない責任ですが、その損害の性質や発生した理由により、免除される場合があります。旅行者に支払われる損害補補償金は、旅行業者が加入している保険でその支払額を補填していますが、以下の項目は、その保険の適用除外の項目とも言えます。
| 補償金が支払われない場合 |
| １．旅行者の故意 |
| ２．死亡補償金を受け取るべき者の故意 ※その者が死亡補償金の一部の受取人である場合は、その他の補償金を受け取る者については、受け取ることができる。 |
| ３．旅行者の自殺行為、犯罪行為、闘争行為 |
| ４．資格を持たない、または違反行為により自動車又は原動機自転車を運転しているときに起こした事故（無免許、酒酔い運転など） ※この行為によって当事者以外の者（同乗者など）が被った傷害には適用される |
| ５．故意にに法令に違反する行為を行ったり、違法サービスの提供を受けているときに起こった事故（違法薬物使用、コピー商品店での買い物など） |
| ６．脳疾患、疾病又は心神喪失 |
| ７．妊娠、出産、早産、流産又は外科的手術その他の医療処置 ※旅行業者が補償する傷害を治療する場合は、適用される |
| ８．旅行者の刑の執行又は拘留・獄中に起きた事故 |
| ９．戦争、外国の武力行使、革命、政権奪取、内乱、武装反乱その他に類似の事変又は暴動 |
| 10．核燃料物質（使用済燃料を含む）若しくは核燃料物質によって汚染されたもの放射性・爆発性その他の有害ない特性またはこれらの特性による事故 |
| 11．9.10に随伴して起きた事故またはこれらに伴う秩序の混乱によって起きた事故 |
| 12．10以外の放射線照射または放射能汚染 |
| 13．頸部症候群（むちうち症）または腰痛で他覚症状のないもの ※他覚症状のないものとは、外傷がなく、外から見る限りその症状の程度が分からないもの |
| 14．国内旅行を目的とする企画旅行のみに適用される事項 ・地震、火山噴火または津波、またはこれらに伴い起きた事故や避難時などの混乱によって起きた事故 ※海外旅行には適用されないことに注意 |
| 15．危険を伴うツアーで、あらかじめ企画旅行の日程に含まれていないもの 例） ・山岳登はん（ピッケル、アイゼン、ザイル、ハンマーなどを使用する登山） ・ボブスレー ・スカイダイビング ・ハンググライダーなどの飛行系搭乗機（動力機付きも含む）ただし、これらがあらかじめ企画旅行の日程に含まれている場合は補償が適用される。また、同旅行中の自由行動中に同種の行為（オプショナルツアーも含む）を行ったときに起きた傷害についても補償が適用される。※企画旅行内で希望者を対象に行われるオプショナルツアーは、本来の旅行の一部として取り扱われるので、補償は本来企画旅行と重複しない（併せて１つの旅行とする） |
| 16．反社会的勢力に該当すると認められること、または反社会的勢力に資金提供し、または不当に利用するもの ※その者が死亡補償金の一部の受取人である場合は、その他の補償金を受け取る者については、受け取ることができる |